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L’Aquitaine compte plus de 2 700 immeubles protégés au titre des Monuments historiques et près de 9 200 objets mobiliers protégés. Le département de la Dordogne, qui abrite un nombre de grottes ornées uniques au monde, la ville de Bordeaux et le département de la Gironde - qui après Paris sont la ville et le département français comportant le plus grand nombre d’édifices protégés au titre des monuments historiques – témoignent tout particulièrement de cette richesse.

La région Aquitaine est également considérée comme la région française disposant du plus grand nombre de biens inscrits sur la liste du patrimoine mondial de l’Unesco, avec un total de 5 ensembles : 

• les sites préhistoriques et les grottes ornées de la vallée de la Vézère ;

• 19 étapes sur l’itinéraire des chemins de Saint-Jacques de Compostelle, parmi lesquelles les cathédrales de Périgueux, Agen et Bayonne, ou l'abbaye de la Sauve Majeure en Gironde, propriété de l'Etat gérée par le Centre des monuments nationaux ;

• la Juridiction de Saint-Émilion, paysage culturel et naturel entièrement dédié à la viticulture ;

• Bordeaux, Port de la Lune, le plus vaste ensemble urbain au monde inscrit sur la liste du patrimoine mondial ;

• les 3 sites formant le «Verrou de l'estuaire», inscrits au titre des fortifications de Vauban : citadelle et Fort Pâté à Blaye, Fort Médoc à Cussac-Fort-Médoc. 

Un 6^e ensemble, qui intégrerait les Quartiers modernes dits Cité Frugès à Pessac, devrait être proposé par la France à l'Unesco, en 2013, sous le titre Le Corbusier, une contribution exceptionnelle au mouvement moderne.

La richesse patrimoniale unique de la région Aquitaine, d'une grande densité en milieu rural, fait l'objet de programmes de protection et de valorisation spécifiques. Ceux-ci visent prioritairement : 

• les sites préhistoriques et les grottes ornées de la vallée de la Vézère et les établissements dédiés à la mise en valeur de ce patrimoine : Pôle international de la Préhistoire (PIP), Musée national de Préhistoire des Eyzies-de-Tayac et pôle mixte de recherche archéologique de Campagne ; 

• l'estuaire de la Gironde : phare de Cordouan ; Grotte de Pair non Pair, propriété de l'Etat gérée par le Centre des monuments nationaux ; espaces naturels et paysagers ; sites de Saint-Germain-d'Esteuil et de Plassac ; «Verrou de l'estuaire», inscrit sur la liste du patrimoine mondial ;

• l'estuaire et le val d'Adour : site de Bayonne ; abbaye d’Arthous, centre d’éducation au patrimoine dans les Landes ; châteaux de Bidache et de Guiche ;

• la Juridiction de Saint-Émilion : site de Saint-Emilion et son église monolithe, inscrits sur la liste du patrimoine mondial.

L'Aquitaine compte 7 monuments et ensembles de sites, propriétés de l'Etat relevant du ministère de la Culture et de la Communication, remis en dotation au Centre des monuments nationaux qui en assure l'ouverture au public, l'administration et la valorisation :

 en Gironde :

 - château de Cadillac

- abbaye de La Sauve-Majeure

- tour Pey-Berland à Bordeaux

- grotte de Pair-non-Pair à Prignac-et-Marcamps ;

en Dordogne :

 - site archéologique de Montcaret

- château de Puyguilhem à Villars

- grottes ornées, abris et gisements près des Eyzies-de-Tayac : grottes des Combarelles, de Font-de-Gaume et de Teyjat ; abris de Laugerie-Haute, du Cap Blanc et du Poisson ; gisements de La Ferrassie, de la Micoque et du Moustier.

Les démarches de mise en valeur du patrimoine portées par les collectivités territoriales et les propriétaires privées bénéficient de labels décernés par le ministère de la Culture et de la Communication. L'Aquitaine compte ainsi 7 territoires labellisés Ville et Pays d'art d'histoire, dont 4 dans les Pyrénées-Atlantiques, 26 parcs et jardins labellisés Jardin remarquable et 36 biens labellisés Patrimoine du XXème siècle.